RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 ATP6AP1Q15904 470 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 HPS1Q92902 700 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 YIPF5Q969M3 257 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 HAVCR1Q96D42 359 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 ZNF799Q96GE5 643 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 INTS14Q96SY0 518 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 MED20Q9H944 212 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 MSL2Q9HCI7 577 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 CENPMQ9NSP4 180 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.9□□□□□ -0.82
GGA3-204ENST00000578208 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LRP5LA4QPB2 252 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 FAM183AA6NL82 134 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNF878C9JN71 531 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 G3V2T6 193 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CRLF1O75462 422 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 GLCEO94923 617 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ADH4P08319 380 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ACSM4P0C7M7 580 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CLUP10909 449 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 TNFRSF1AP19438 455 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 RPS27P42677 84 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CRYBB2P43320 205 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SLC15A1P46059 708 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CCNIQ14094 377 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 TRIP10Q15642 601 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 KLHL12Q53G59 568 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 TEX30Q5JUR7 227 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ACSM5Q6NUN0 579 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SHFQ7M4L6 423 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 OR5AS1Q8N127 324 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNF511Q8NB15 262 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 RAB1CQ92928 201 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 MAP6Q96JE9 813 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 WDR76Q9H967 626 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 NTN4Q9HB63 628 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 KRT84Q9NSB2 600 aa9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 HIVEP2P31629 2446 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 EBAG9O00559 213 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PRODHO43272 600 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LMX1BO60663 402 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LILRA1O75019 489 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 RP2O75695 350 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 TGFAP01135 160 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CD55P08174 381 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 HNF1AP20823 631 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 HSD11B1P28845 292 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CRISP1P54107 249 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ESRRGP62508 458 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CDK5Q00535 292 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CDK5R2Q13319 367 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SNAPC1Q16533 368 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 OR2T2Q6IF00 324 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 FAHD1Q6P587 224 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 DRAM2Q6UX65 266 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PGAP1Q75T13 922 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 PARP8Q8N3A8 854 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 OR8G5Q8NG78 346 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 OR13G1Q8NGZ3 307 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 CCL17Q92583 94 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 KCNJ15Q99712 375 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 SP140LQ9H930 580 aa9.88□□□□□ -0.83
GGA3-204ENST00000578208 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms