RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556251.1

RAD51B-223, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 4

Gene RAD51B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-223	ENST00000556251	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	REEP1	Q9H902	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MED20	Q9H944	212 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	WDR76	Q9H967	626 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MTOR	P42345	2549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		F5H5K5	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		H3BN98	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		H7C417	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DCTN6	O00399	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RER1	O15258	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PAX4	O43316	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SGCE	O43556	437 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	E2F6	O75461	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NCR1	O76036	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ABHD16A	O95870	558 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHM	P01871	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CLU	P10909	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NR2C1	P13056	603 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PRKACG	P22612	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GCH1	P30793	250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC6A6	P31641	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IL2RG	P31785	369 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	GLRX	P35754	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IFNGR2	P38484	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	WNT5A	P41221	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	UCP2	P55851	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SMIM11A	P58511	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CCL8	P80075	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DGCR6	Q14129	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FLOT2	Q14254	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LNX2	Q8N448	690 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR2T29	Q8NH02	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DOK1	Q99704	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	ISPD	A4D126	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		B5MCH6	92 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251		M0R129	80 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	WNT9B	O14905	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAD51B-223	ENST00000556251	SYNGR3	O43761	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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