RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM218	A2RU14	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM221A	A4D161	298 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TRAPPC6A	O75865	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ACTL6A	O96019	429 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ADA	P00813	363 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CPN1	P15169	458 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CEL	P19835	753 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MPG	P29372	298 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	POU3F4	P49335	361 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ASCL1	P50553	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MMP15	P51511	669 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF136	P52737	540 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RAB5B	P61020	215 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DEFA6	Q01524	100 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NNAT	Q16517	81 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TEX30	Q5JUR7	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MOB3C	Q70IA8	216 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FBXO17	Q96EF6	278 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	LRR1	Q96L50	414 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CALHM2	Q9HA72	323 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	F8	P00451	2351 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HIVEP1	P15822	2718 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984		A0A087WV62	115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TXNL1	O43396	289 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CBR3	O75828	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IL18BP	O95998	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HEXA	P06865	529 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IFI6	P09912	130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	IFNGR1	P15260	489 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RAD52	P43351	418 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NPBWR1	P48145	328 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	MTNR1B	P49286	362 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	AKR1C2	P52895	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PRR5	P85299	388 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	AKR1C1	Q04828	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GAB1	Q13480	694 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NAA40	Q86UY6	237 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	KLB	Q86Z14	1044 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	SKA3	Q8IX90	412 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OR10A4	Q9H209	315 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	NANS	Q9NR45	359 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TREM2	Q9NZC2	230 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF69	Q9UC07	566 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	OPN4	Q9UHM6	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	RASD1	Q9Y272	281 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FFAR1	O14842	300 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	ACP2	P11117	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	FOLR2	P14207	255 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	HPGD	P15428	266 aa		5.76	□□□□□ -1.49
FGD4-215	ENST00000551984	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49

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