RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531041.1

SF3B2-211, Transcript of splicing factor 3b subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SF3B2, Length 1,440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SF3B2-211ENST00000531041 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.58□□□□□ -0.07
SF3B2-211ENST00000531041 CACNA1DQ01668 2161 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 ACOD1A6NK06 481 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 GPRIN2O60269 458 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 LCATP04180 440 aa14.58□□□□□ -0.08
SF3B2-211ENST00000531041 TACSTD2P09758 323 aa14.58□□□□□ -0.08
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