RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 PITX2Q99697 317 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 NPTNQ9Y639 398 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TCF21O43680 179 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CCNB2O95067 398 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFSF4P23510 183 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 DHFR2Q86XF0 187 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR4Q3Q8NH05 313 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 IL19Q9UHD0 177 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 METRNQ9UJH8 293 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 U3KQV3 271 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 F5H5K5 113 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 H0YL77 283 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 HLA-DQA2P01906 255 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SBK2P0C263 348 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 LCN2P80188 198 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC36A3Q495N2 470 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR8G5Q8NG78 346 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR52L1Q8NGH7 329 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ATF6BQ99941 703 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TVP23AA6NH52 213 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MLNRO43193 412 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SOX14O95416 240 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFRSF1AP19438 455 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CALB2P22676 271 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MMP16P51512 607 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ZMYND11Q15326 602 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 LIPNQ5VXI9 398 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MUC13Q9H3R2 512 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 GCM1Q9NP62 436 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OPN4Q9UHM6 478 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0G2JMP0 313 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0X1KG70 313 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 C5orf63A6NC05 138 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 VENTXO95231 258 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ADRA2CP18825 462 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR2T5Q6IEZ7 315 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 LNX2Q8N448 690 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 LINC00471Q8N535 108 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OR2T29Q8NH02 315 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 OCEL1Q9H607 264 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3-204ENST00000528201 TANC2Q9HCD6 1990 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1B0GWJ7 208 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM178BH3BS89 294 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ACOT8O14734 319 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 BTG1P62324 171 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ECH1Q13011 328 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CRMP1Q14194 572 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 MICAQ29983 383 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 F5H5P2 479 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SURF4O15260 269 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 GYPBP06028 91 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 CLUP10909 449 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 SELEP16581 610 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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