RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 COPS3Q9UNS2 423 aa16.14■□□□□ 0.17
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PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
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PTPRK-218ENST00000525459 E7EQL1 145 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
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PTPRK-218ENST00000525459 SYS1Q8N2H4 156 aa16.11■□□□□ 0.17
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PTPRK-218ENST00000525459 NEUROG1Q92886 237 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM80Q96HE8 168 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 OR51B6Q9H340 312 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-218ENST00000525459 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.11■□□□□ 0.17
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