RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 DNM1P46Q6ZS02 220 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZTC4 211 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GATSQ8NAP1 163 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CLHC1Q8NHS4 586 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 AGR3Q8TD06 166 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LZICQ8WZA0 190 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ORAI1Q96D31 301 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RAB39BQ96DA2 213 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TIMD4Q96H15 378 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF479Q96JC4 524 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CENPHQ9H3R5 247 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.61□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.61□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.61□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 COL6A5A8TX70 2615 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZANQ9Y493 2812 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 JMJD1CQ15652 2540 aa3.61□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 STAB1Q9NY15 2570 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM120BA0PK00 339 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA9B4DS77 424 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 B4DSR2 109 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 J3QLI3 93 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 M0R1B8 84 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 M0R233 179 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ANGPT2O15123 496 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SURF4O15260 269 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNHIT1O43257 154 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CHP2O43745 196 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 SYNGR3O43761 229 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 FCMRO60667 390 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NPIPB7O75200 414 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RAD51DO75771 328 aa3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 ZNF432O94892 652 aa3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 IGLV1-44P01699 117 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IGHG1P01857 330 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 BCHEP06276 602 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF23P17027 643 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GPX2P18283 190 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ACHEP22303 614 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP5-9P26371 169 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 GLRXP35754 106 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 MNAT1P51948 309 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 PPP5CP53041 499 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS3BPQ08380 585 aa3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 BST1Q10588 318 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZP4Q12836 540 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 GSG1Q2KHT4 349 aa3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC36A2Q495M3 483 aa3.6□□□□□ -1.83
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HDAC2-216ENST00000523628 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 RNF130Q86XS8 419 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CDK20Q8IZL9 346 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF786Q8N393 782 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.6□□□□□ -1.83
HDAC2-216ENST00000523628 OR5D16Q8NGK9 328 aa3.6□□□□□ -1.83
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