RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	ICOSLG	O75144	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MELTF	P08582	738 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLL1	P15814	213 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ADORA1	P30542	326 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	BTD	P43251	543 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	BLVRA	P53004	296 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMM10	P62072	90 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF92	Q03936	586 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TWF1	Q12792	350 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6V1F	Q16864	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UNC93A	Q86WB7	457 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MREG	Q8N565	214 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR9G1	Q8NH87	305 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ITFG1	Q8TB96	612 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FANK1	Q8TC84	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXC2	Q99958	501 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CNPY3	Q9BT09	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CD209	Q9NNX6	404 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	EXD2	Q9NVH0	621 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CALY	Q9NYX4	217 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NHS	Q6T4R5	1651 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0D9SFI3	127 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	HACD1	B0YJ81	288 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702		K7N7A8	449 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SOCS3	O14543	225 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SNAI2	O43623	268 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DPM1	O60762	260 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC166	P0CW27	439 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CMA1	P23946	247 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP1	P29972	269 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PCK1	P35558	622 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINB8	P50452	374 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2B6	P58173	313 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE2G2	P60604	165 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL6	P60660	151 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PAFAH1B2	P68402	229 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35B1	P78383	322 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CD47	Q08722	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C2CD6	Q53TS8	623 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF14	Q92956	283 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM54	Q969K7	222 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	RPE	Q96AT9	228 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	FGGY	Q96C11	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC45	Q96CN5	670 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINB12	Q96P63	405 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	TSG101	Q99816	390 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	MICU1	Q9BPX6	476 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	DRC3	Q9H069	523 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	SYT4	Q9H2B2	425 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FAM49B-222	ENST00000522702	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		3.09	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms