RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515918.1

RNU6-488P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 488, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-488P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-488P-201ENST00000515918 IGLV2-23P01705 113 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR8U9P0C7N5 309 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CD37P11049 281 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CRISP2P16562 243 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RAB3BP20337 219 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 IL32P24001 234 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDKN2BP42772 138 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 STX17P56962 302 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC7A9P82251 487 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 LRRC63Q05C16 580 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DGCR6Q14129 220 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ANGPT1Q15389 498 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 TAL2Q16559 108 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 POU2AF1Q16633 256 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DUPD1Q68J44 220 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF470Q6ECI4 717 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ERICH5Q6P6B1 374 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 FBXW12Q6X9E4 464 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SPATA24Q86W54 205 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CBR4Q8N4T8 237 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDRT4Q8N9R6 151 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR6K6Q8NGW6 343 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR8U1Q8NH10 309 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR4S2Q8NH73 311 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CLHC1Q8NHS4 586 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ACTRT1Q8TDG2 376 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CDKL2Q92772 493 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 GABRG3Q99928 467 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ULBP2Q9BZM5 246 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 FBXO8Q9NRD0 319 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SLC7A10Q9NS82 523 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RMND1Q9NWS8 449 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CD300AQ9UGN4 299 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ENPP5Q9UJA9 477 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CHD4Q14839 1912 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PLAC8L1A1L4L8 177 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 MGAT4DA6NG13 374 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RDH16O75452 317 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PTTG1O95997 202 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPN2P04844 631 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 GNRHRP30968 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PFN2P35080 140 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CEACAM6P40199 344 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 MYCNOSP40205 109 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PRLHRP49683 370 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CRISP3P54108 245 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR2B6P58173 313 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 TIMM10P62072 90 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPL31P62899 125 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 IFFO1Q0D2I5 559 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PSG5Q15238 335 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RGNQ15493 299 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 IL17AQ16552 155 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CPTPQ5TA50 214 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ZNF774Q6NX45 483 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 FAHD1Q6P587 224 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PLET1Q6UQ28 207 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CD300LGQ6UXG3 332 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 H2AFVQ71UI9 128 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 ABHD13Q7L211 337 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CD302Q8IX05 232 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 DAW1Q8N136 415 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 GPD1LQ8N335 351 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CYB561A3Q8NBI2 242 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 LRRC29Q8WV35 223 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RCN3Q96D15 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 SEH1LQ96EE3 360 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 GALNT14Q96FL9 552 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OSBPL11Q9BXB4 747 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 C1orf198Q9H425 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 TNFRSF19Q9NS68 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 MS4A12Q9NXJ0 267 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 CES1P1Q9UKY3 287 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 OR51B2Q9Y5P1 312 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-488P-201ENST00000515918 TRPC5OSA6NMA1 111 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms