RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MRO	Q9BYG7	248 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	CLN6	Q9NWW5	311 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ACOD1	A6NK06	481 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	LCAT	P04180	440 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ACSM4	P0C7M7	580 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	DCTD	P32321	178 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	CDKN1A	P38936	164 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	WNT5A	P41221	380 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC6A9	P48067	706 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OCLN	Q16625	522 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	KRT77	Q7Z794	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ST7L	Q8TDW4	575 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MAP6	Q96JE9	813 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC29A1	Q99808	456 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ABHD6	Q9BV23	337 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	CREBBP	Q92793	2442 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TMEM129	A0AVI4	362 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	XRCC2	O43543	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR2T7	P0C7T2	308 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ALOX5AP	P20292	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TNFSF4	P23510	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	EPHA2	P29317	976 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	IL18R1	Q13478	541 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR2T27	Q8NH04	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	HAVCR1	Q96D42	359 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SYT3	Q9BQG1	590 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OR51B6	Q9H340	312 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	RGCC	Q9H4X1	137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TACC2	O95359	2948 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	PLCE1	Q9P212	2302 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	AKAP6	Q13023	2319 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294		H0YJX3	145 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	NDUFS8	O00217	210 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	NGF	P01138	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	KITLG	P21583	273 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MTNR1A	P48039	350 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ACTC1	P68032	377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ACTA1	P68133	377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	EGR3	Q06889	387 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	TESK1	Q15569	626 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294		Q5PR19	223 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	LPCAT4	Q643R3	524 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SLC22A4	Q9H015	551 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	POLQ	O75417	2590 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	CCDC182	A6NF36	153 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294		E9PQ18	207 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294		H0YAE9	185 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SELENOF	O60613	162 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	ADRA2A	P08913	450 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	DBH	P09172	617 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	SBK2	P0C263	348 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	DDOST	P39656	456 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SH3BP2-208	ENST00000504294	OPRL1	P41146	370 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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