RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.07□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.07□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TRIP11Q15643 1979 aa3.07□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FUOMA2VDF0 154 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FAM231BA6NCW3 169 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 BTBD17A6NE02 478 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 KLLNB2CW77 178 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 H3BSA7 217 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 EMC8O43402 210 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CIB2O75838 187 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 IGHG4P01861 327 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINA6P08185 405 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 THRAP10827 490 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 MYL2P10916 166 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 COX7A1P24310 79 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CD1BP29016 333 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 MYH11P35749 1972 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 APOC4P55056 127 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SP4Q02446 784 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 KLRB1Q12918 225 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 OXA1LQ15070 435 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 BCL7AQ4VC05 210 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LPCAT4Q643R3 524 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 Q6ZS52 159 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 C4orf33Q8N1A6 199 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 LINC01006Q8NI28 216 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ITFG1Q8TB96 612 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CMTM7Q96FZ5 175 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 C9orf72Q96LT7 481 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 HIST1H4GQ99525 98 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 DOK1Q99704 481 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ACP6Q9NPH0 428 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 AIG1Q9NVV5 245 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 GIN1Q9NXP7 522 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ASF1AQ9Y294 204 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PIGLQ9Y2B2 252 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM131Q92545 1883 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 ITPR3Q14573 2671 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 A0A0G2JND7 137 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 H3BNH8 94 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 NBR2O15453 112 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FCMRO60667 390 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RAMP3O60896 148 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SULT1C4O75897 302 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SUPT7LO94864 414 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TNFAIP8O95379 198 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 POLR2MP0CAP2 368 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 FUT3P21217 361 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PTGDSP41222 190 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 CXCL12P48061 93 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 BCAP31P51572 246 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 RIPPLY3P57055 190 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 NUP107P57740 925 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SEC61GP60059 68 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 PRPS1P60891 318 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TLE4Q04727 773 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 STX3Q13277 289 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 SPCS2Q15005 226 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1B-215ENST00000498054 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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