RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496076.1

CLTC-208, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 2

Gene CLTC, Length 678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-208ENST00000496076 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.56□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 CD84Q9UIB8 345 aa2.56□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 PSG8Q9UQ74 426 aa2.56□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 KCNE3Q9Y6H6 103 aa2.56□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 SLC22A20A6NK97 555 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 H7C417 338 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 WDR62O43379 1518 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ZNF861PO60384 105 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ENTPD5O75356 428 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 AQP8O94778 261 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ETHE1O95571 254 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 SLC25A27O95847 323 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 CATP04040 527 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 PPP1CBP62140 327 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 METTL21CQ5VZV1 264 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 Q6P435 159 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ASCL4Q6XD76 172 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 Q8N9L7 120 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 GPR26Q8NDV2 337 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 OR5AR1Q8NGP9 310 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ITFG1Q8TB96 612 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 BAALCQ8WXS3 180 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 SCGB3A2Q96PL1 93 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 CALN1Q9BXU9 219 aa2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 TM6SF2Q9BZW4 377 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 CD209Q9NNX6 404 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 MTFP1Q9UDX5 166 aa2.55□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 C11orf94C9JXX5 98 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 PANO1I0J062 215 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -22e-6■■■■■ 31.7
CLTC-208ENST00000496076 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 RETP07949 1114 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 CD37P11049 281 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 P2RX1P51575 399 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 RPS23P62266 143 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 FAM58AQ8N1B3 248 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 METTL13Q8N6R0 699 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 OR13C9Q8NGT0 318 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 CACNG8Q8WXS5 425 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 FAM131CQ96AQ9 280 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 RNF145Q96MT1 663 aa2.54□□□□□ -2
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CLTC-208ENST00000496076 HINT2Q9BX68 163 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 SPNS1Q9H2V7 528 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa2.54□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 A0A1B0GUA9 196 aa2.53□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 HACD1B0YJ81 288 aa2.53□□□□□ -2
CLTC-208ENST00000496076 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.53□□□□□ -2
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