RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 NOVP48745 357 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 AP1S2P56377 157 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R19P59542 299 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 TCP10Q12799 353 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF691Q5VV52 312 aa3.57□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.57□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.57□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 BCORL1Q5H9F3 1711 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CUL7Q14999 1698 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 CFTRP13569 1480 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SBNO1A3KN83 1393 aa3.56□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 EOGTQ5NDL2 527 aa3.56□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 OR51A7Q8NH64 312 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa3.56□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 SMIM14Q96QK8 99 aa3.56□□□□□ -1.84
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CCL20-204ENST00000489160 C6orf50Q9HD87 102 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 EMC3Q9P0I2 261 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 VAPAQ9P0L0 249 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PRELID1Q9Y255 219 aa3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 PTPRMP28827 1452 aa3.55□□□□□ -1.84
CCL20-204ENST00000489160 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa3.55□□□□□ -1.84
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