RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 OR5H1A6NKK0 313 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF878C9JN71 531 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C16orf97H3BN30 126 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SGCEO43556 437 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AGFG2O95081 481 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HLA-HP01893 362 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MT-ND2P03891 347 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KRT8P05787 483 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PSKH1P11801 424 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF32P17041 273 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 AGAP20933 346 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 UGT2B10P36537 528 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ARR3P36575 388 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HTR5AP47898 357 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CDH15P55291 814 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PIGFQ07326 219 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RAB35Q15286 201 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TAF13Q15543 124 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GABRA6Q16445 453 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PCK2Q16822 640 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GSG1Q2KHT4 349 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 XKRXQ6PP77 449 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CORO6Q6QEF8 472 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SKA3Q8IX90 412 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SNX33Q8WV41 574 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SGCDQ92629 289 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 S100PBPQ96BU1 408 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 WACQ9BTA9 647 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ABHD6Q9BV23 337 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ALG8Q9BVK2 526 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MND1Q9BWT6 205 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C1orf198Q9H425 327 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 DUSP21Q9H596 190 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 COPS3Q9UNS2 423 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FLNCQ14315 2725 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MED12LQ86YW9 2145 aa6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 A0A087WXM4 84 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PR80 420 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 J3QRE1 110 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 RER1O15258 196 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 CLDN14O95500 239 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HTR1AP08908 422 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 H2BFMP0C1H6 154 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PATE4P0C8F1 98 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PLA2G2AP14555 144 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PPP3CBP16298 524 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ALOX5APP20292 161 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HSD11B1P28845 292 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 HCCSP53701 268 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SORDQ00796 357 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF85Q03923 595 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 FAM27E3Q08E93 113 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GTF3C1Q12789 2109 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF774Q6NX45 483 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SSX8Q7RTT4 187 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 SSX6Q7RTT6 188 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 KRT77Q7Z794 578 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 MDP1Q86V88 176 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 GJC3Q8NFK1 279 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.66□□□□□ -1.34
GARNL3-218ENST00000487565 OR52N1Q8NH53 320 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms