RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487008.1

RAB17-211, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB17, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-211	ENST00000487008	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	LIPA	P38571	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	MMP15	P51511	669 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TPTE	P56180	551 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PSG7	Q13046	419 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	APOF	Q13790	326 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF786	Q8N393	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	STMN2	Q93045	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF799	Q96GE5	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	COPS4	Q9BT78	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	MTOR	P42345	2549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	EI24	O14681	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	SELENOF	O60613	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RAC2	P15153	192 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	KITLG	P21583	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	SLC15A1	P46059	708 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF81	P51508	661 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TAF13	Q15543	124 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CARTPT	Q16568	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CMBL	Q96DG6	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008		M0R129	80 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	NCR1	O76036	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	HPX	P02790	462 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	LCAT	P04180	440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	GIF	P27352	417 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	MAGEB1	P43366	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	SLC6A9	P48067	706 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ALDH3A2	P51648	485 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RAD23A	P54725	363 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	EFNB1	P98172	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZSCAN26	Q16670	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	TEAD3	Q99594	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	SMR3A	Q99954	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008	CR1	P17927	2039 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAB17-211	ENST00000487008		A0A096LNT2	108 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	LYN	P07948	512 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	ADH4	P08319	380 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	NR4A2	P43354	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	PRKX	P51817	358 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CCL8	P80075	99 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MALL	Q13021	153 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	RDH5	Q92781	318 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAB17-211	ENST00000487008	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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