RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 SFXN2Q96NB2 322 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CHIAQ9BZP6 476 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 HPF1Q9NWY4 346 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC17A2O00624 439 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 XKRYO14609 159 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR2T1O43869 369 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GMFGO60234 142 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TOXO94900 526 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NUDT14O95848 222 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CD2P06729 351 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FSTP19883 344 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CD96P40200 585 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 AQP2P41181 271 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 EIF1P41567 113 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FGL1Q08830 312 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FOXF1Q12946 379 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZMYND11Q15326 602 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 BEST3Q8N1M1 668 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GINS4Q9BRT9 223 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 BEX1Q9HBH7 125 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FANCFQ9NPI8 374 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 KLK11Q9UBX7 282 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OPN4Q9UHM6 478 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FLVCR2Q9UPI3 526 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MEGF11A6BM72 1044 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MS4A18H0YCH9 400 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PLPP3O14495 311 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CBR3O75828 277 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SCGNO76038 276 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NEURL1O76050 574 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PMS2P2O95744 297 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ACSM4P0C7M7 580 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 UBBP0CG47 229 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RPA2P15927 270 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ALOX5APP20292 161 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 IL11P20809 199 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 CNR1P21554 472 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 DCTDP32321 178 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS3P35030 304 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R19P59542 299 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 FOXO1Q12778 655 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SGCBQ16585 318 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MS4A18Q3C1V0 323 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM65Q6PI78 240 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OTOSQ8NHW6 89 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 MCHR2Q969V1 340 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM106AQ96A25 262 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 OR11A1Q9GZK7 315 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-208ENST00000486964 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.54□□□□□ -1.04
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