RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484893.1

GINS1-204, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GINS1, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-204ENST00000484893 KCNJ15Q99712 375 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR51B6Q9H340 312 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CENPMQ9NSP4 180 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa11.17□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 F5H5K5 113 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 M0R135 149 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PSMD9O00233 223 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 IGHA1P01876 353 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR2T7P0C7T2 308 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SERPINF1P36955 418 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MPV17P39210 176 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 RAD52P43351 418 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CXCR4P61073 352 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PPP1CBP62140 327 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 GALK2Q01415 458 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MVKQ03426 396 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 VHLLQ6RSH7 139 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SETD9Q8NE22 299 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR2T27Q8NH04 317 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ABHD4Q8TB40 342 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF799Q96GE5 643 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 Q96MT0 163 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MNTQ99583 582 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 VCX3BQ9H321 246 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PLK3Q9H4B4 646 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 POU2F3Q9UKI9 436 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FZR1Q9UM11 496 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LRP12Q9Y561 859 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 NOTCH2Q04721 2471 aa11.16□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ARID1AO14497 2285 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PNPP00491 289 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SLC2A1P11166 492 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FABP6P51161 128 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PRKXP51817 358 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 GRB2P62993 217 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 DRAM2Q6UX65 266 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ZNF679Q8IYX0 411 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 MUC15Q8N387 334 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 OR1J1Q8NGS3 322 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 GGHQ92820 318 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TBX5Q99593 518 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 COPS4Q9BT78 406 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 JAM3Q9BX67 310 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 ELOVL3Q9HB03 270 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.15□□□□□ -0.62
GINS1-204ENST00000484893 J3QW42 95 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 XPNPEP2O43895 674 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 IGHV3-13P01766 116 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RAF1P04049 648 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LIMS3P0CW19 117 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 LIMS4P0CW20 117 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PAX1P15863 534 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 DCTDP32321 178 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 EVX1P49640 407 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RGS6P49758 472 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 TPTEP56180 551 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 EGR3Q06889 387 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RAB40BQ12829 278 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 PSG7Q13046 419 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 DOC2BQ14184 412 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.14□□□□□ -0.63
GINS1-204ENST00000484893 OR10H4Q8NGA5 316 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms