RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484474.1

ERBB4-208, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 4, human

TSL 3

Gene ERBB4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB4-208	ENST00000484474	LSAMP	Q13449	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	P2RY6	Q15077	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SSX1	Q16384	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SGCA	Q16586	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474		Q499Y3	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ARL9	Q6T311	187 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	WBP1	Q96G27	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	FOXB1	Q99853	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474		R4GMQ9	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474		A0A075B6Q4	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474		A0A1B0GTH9	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474		H0YC42	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	GABRP	O00591	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CASK	O14936	926 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RAMP1	O60894	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UPK3A	O75631	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	GPX5	O75715	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SC5D	O75845	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UBL3	O95164	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OCM2	P0CE71	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SRM	P19623	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TUBG1	P23258	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OPRM1	P35372	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR3A2	P47893	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	HCCS	P53701	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CASP6	P55212	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TPTE	P56180	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PER3	P56645	1201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SCAND1	P57086	179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	VBP1	P61758	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	FMOD	Q06828	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	KLRB1	Q12918	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	RAB35	Q15286	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ETFDH	Q16134	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MOG	Q16653	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms