RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC1A7	O00341	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNAB3	O43448	404 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ENTPD6	O75354	484 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	RP2	O75695	350 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	REN	P00797	406 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CD79A	P11912	226 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NR2C1	P13056	603 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC2A5	P22732	501 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	HTR1F	P30939	366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC15A1	P46059	708 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CENPA	P49450	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	GALK2	Q01415	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	TXNDC15	Q96J42	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	OR6C68	A6NDL8	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHG1	P01857	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PGA4	P0DJD7	388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PGA3	P0DJD8	388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	FMO3	P31513	532 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	BID	P55957	195 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PIGF	Q07326	219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	HIST3H3	Q16695	136 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MED29	Q9NX70	200 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SERPINI2	O75830	405 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NCR1	O76036	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	LYN	P07948	512 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NAT2	P11245	290 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CRABP1	P29762	137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC35A2	P78381	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MELK	Q14680	651 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2T4	Q8NH00	348 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A0G2JMP0	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A0X1KG70	313 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A1W2PPW3	197 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	UBL3	O95164	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	RAB36	O95755	333 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TSSC4-208	ENST00000467308	AVP	P01185	164 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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