RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 CDH20Q9HBT6 801 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR6C6A6NF89 314 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 J3QRE1 110 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PTHP01270 115 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CRYAAP02489 173 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LYNP07948 512 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ADRA2AP08913 450 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T7P0C7T2 308 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF35P13682 527 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PTAFRP25105 342 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CXCR4P61073 352 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GALK2Q01415 458 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF85Q03923 595 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF13Q15543 124 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL22Q53GT1 634 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC22A25Q6T423 547 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SSX6Q7RTT6 188 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT77Q7Z794 578 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NAA40Q86UY6 237 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2T27Q8NH04 317 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 COQ7Q99807 217 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ATF6BQ99941 703 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 COPS4Q9BT78 406 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 Q9H521 79 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 AKAP6Q13023 2319 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPR1 153 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DAPL1A0PJW8 107 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SHISA9B4DS77 424 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF878C9JN71 531 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PTGES3LE9PB15 166 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 F5H5K5 113 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC1A7O00341 560 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 H2BFMP0C1H6 154 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ACSM4P0C7M7 580 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 COX5BP10606 129 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT5AP41221 380 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC15A1P46059 708 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKXP51817 358 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NR1H2P55055 460 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MVKQ03426 396 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TLE4Q04727 773 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 HGFACQ04756 655 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB40BQ12829 278 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT80Q6KB66 452 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LHFPL3Q86UP9 236 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 C4orf45Q96LM5 186 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8B4Q96RC9 309 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 MNTQ99583 582 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 DSCAMO60469 2012 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM221AA4D161 298 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 C5orf63A6NC05 138 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 E7EQL1 145 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 PHYHO14832 338 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 CTAG2O75638 210 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 ABHD16AO95870 558 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD28-208ENST00000463533 NGFP01138 241 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms