RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 TCTN2Q96GX1 697 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PARD6AQ9NPB6 346 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SPTBP11277 2137 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF735P0CB33 412 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CD59P13987 128 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ITGA3P26006 1051 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 GRK6P43250 576 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PPICP45877 212 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 HMGN3Q15651 99 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR2L5Q8NG80 312 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MITD1Q8WV92 249 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 DCUN1D4Q92564 292 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SMIM10Q96HG1 83 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PRRX2Q99811 253 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 KPTNQ9Y664 436 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CUL9Q8IWT3 2517 aa15.1■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 NCMAPQ5T1S8 102 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF614Q8N883 585 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF417Q8TAU3 575 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SEH1LQ96EE3 360 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PHB2Q99623 299 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CES1P1Q9UKY3 287 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 FAM157AC9JC47 383 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC31A2O15432 143 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO24O75426 580 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 AGR2O95994 175 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CRHP06850 196 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 FCGR3AP08637 254 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 MAOAP21397 527 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 POU3F4P49335 361 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TAS2R60P59551 318 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PYY3Q5JQD4 70 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC48A1Q6P1K1 146 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CARFQ8N187 725 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ARRDC1Q8N5I2 433 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 OR13C8Q8NGS7 320 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 Q96M85 177 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 STARD5Q9NSY2 213 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.09■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PPH5 198 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TVP23AA6NH52 213 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 C9JQL5 133 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 AIFM1O95831 613 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 IL2RAP01589 272 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TACSTD2P09758 323 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 CD80P33681 288 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 NBL1P41271 181 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 FHL1Q13642 323 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 KCNAB1Q14722 419 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 TGIF1Q15583 401 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF383Q8NA42 475 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 SLAMF9Q96A28 289 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 KIRREL1Q96J84 757 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 POMT1Q9Y6A1 747 aa15.08■□□□□ 0.01
CNGA3-205ENST00000436404 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 ALOX12BO75342 701 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 RPP14O95059 124 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 CFPP27918 469 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 SLC6A9P48067 706 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.08■□□□□ 0
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD12Q6NUT3 480 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms