RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CDRT15Q96T59 188 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 PITX2Q99697 317 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MRI1Q9BV20 369 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 GCM1Q9NP62 436 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 OR5V1Q9UGF6 321 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TAGLN3Q9UI15 199 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 AUP1Q9Y679 476 aa12.77□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ARPC2O15144 300 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 KRT36O76013 467 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 GPANK1O95872 356 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 RRM2P31350 389 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ERFP50548 548 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MMP16P51512 607 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MXRA7P84157 204 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TSPAN31Q12999 210 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CORO6Q6QEF8 472 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZBTB46Q86UZ6 589 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 LINC00471Q8N535 108 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 OR10AD1Q8NGE0 317 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SLC6A7Q99884 636 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ATF6BQ99941 703 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 IL1RAPQ9NPH3 570 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TMEM100Q9NV29 134 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 OPN4Q9UHM6 478 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 KCNG2Q9UJ96 466 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 LRCH1Q9Y2L9 728 aa12.76□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TMEM89A2RUT3 159 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 A8MXK9 166 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 F5H5K5 113 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 DYSFO75923 2080 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 DCTN3O75935 186 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZNF823P16415 610 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CFPP27918 469 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 GSSP48637 474 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MNAT1P51948 309 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TPTEP56180 551 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ANK2Q01484 3957 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZNF154Q13106 437 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SLC18B1Q6NT16 456 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 COLCA1Q6ZS62 124 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 LINC00346Q8IVM7 164 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 C3orf56Q8N813 242 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 OR52E2Q8NGJ4 325 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SLC30A2Q9BRI3 323 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MMP26Q9NRE1 261 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 MIOXQ9UGB7 285 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CD300AQ9UGN4 299 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CEACAM18A8MTB9 384 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 F5H0A9 414 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 FSHBP01225 129 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 LCATP04180 440 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ACSM4P0C7M7 580 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 IRF2P14316 349 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 RPS2P15880 293 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZNF12P17014 697 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZNF181Q2M3W8 571 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 BTNL3Q6UXE8 466 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ZNF620Q6ZNG0 422 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 PGAP1Q75T13 922 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 DEFB107AQ8IZN7 70 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 C22orf15Q8WYQ4 148 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SPTSSAQ969W0 71 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 ERGIC1Q969X5 290 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHA8Q96JA3 519 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 NUP50Q9UKX7 468 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 INSIG2Q9Y5U4 225 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CDH10Q9Y6N8 788 aa12.74□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 OR6C68A6NDL8 312 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 F5H5P2 479 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TRAPPC2LH3BP13 241 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 FSTL3O95633 263 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 WNT2P09544 360 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 RAD23AP54725 363 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 GNB2P62879 340 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa12.73□□□□□ -0.37
HERC3-206ENST00000431413 PGBD2Q6P3X8 592 aa12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms