RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 Q6ZRG5 221 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 VWCEQ96DN2 955 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 KIRREL1Q96J84 757 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 PFDN5Q99471 154 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 GDE1Q9NZC3 331 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 MED12Q93074 2177 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 PRSS38A1L453 326 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 S1PR1P21453 382 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 SCAND1P57086 179 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 FGGYQ96C11 551 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 OR2M4Q96R27 311 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 TMEM100Q9NV29 134 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 MAFFQ9ULX9 164 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 LRP12Q9Y561 859 aa14.91□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 EFCAB7A8K855 629 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 NME2P1O60361 137 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 WISP1O95388 367 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 ITGA3P26006 1051 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 AWAT1Q58HT5 328 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 OR4K15Q8NH41 348 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 RNF128Q8TEB7 428 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 OR10C1Q96KK4 312 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 NICN1Q9BSH3 213 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 ABHD6Q9BV23 337 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 F8VVB4 439 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 F8VWA3 439 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 MELTFP08582 738 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CT45A8P0DMV1 189 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CT45A9P0DMV2 189 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CEBPGP53567 150 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 HTRA3P83110 453 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 MED25Q71SY5 747 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 RGCCQ9H4X1 137 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.9□□□□□ -0.02
PKP4-204ENST00000421462 RAB27BO00194 218 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 KNG1P01042 644 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 CTLA4P16410 223 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 S100PP25815 95 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 FAM166AQ6J272 317 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 DRAM2Q6UX65 266 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 RNF144BQ7Z419 303 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 VSTM2LQ96N03 204 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 OR51M1Q9H341 326 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 WBP1LQ9NX94 342 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SCGB1D2O95969 90 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SLC35E2P0CK97 266 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 OR2A2Q6IF42 318 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 MAP3K3Q99759 626 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 LYRM4Q9HD34 91 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 REV3LO60673 3130 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 C7orf77A4D0Y5 90 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 YIF1AO95070 293 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 CLDN6P56747 220 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 C2orf27AQ580R0 203 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 COMMD2Q86X83 199 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.89□□□□□ -0.03
PKP4-204ENST00000421462 RAB33BQ9H082 229 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms