RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SP140LQ9H930 580 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYSLTR2Q9NS75 346 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GMPPBQ9Y5P6 360 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNTNA6NMZ2 147 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R129 80 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC16A6O15403 523 aa13.11□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEGS2Q6QHC5 323 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.11□□□□□ -0.31
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.11□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.11□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.11□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM118AQ9NWS6 357 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 STARD10Q9Y365 291 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SBK2P0C263 348 aa13.08□□□□□ -0.32
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPCAT4Q643R3 524 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHOXF1Q8NHV9 184 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMBLQ96DG6 245 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
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