RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SRMP19623 302 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DTYMKP23919 212 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SSTR5P35346 364 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OPRK1P41145 380 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RPS5P46782 204 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC3Q13217 504 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR7A5Q15622 319 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 HIKESHIQ53FT3 197 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LIN9Q5TKA1 542 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SAXO2Q658L1 398 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM53Q6P2H8 277 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SSX9Q7RTT3 188 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OSR2Q8N2R0 312 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL13Q8N6R0 699 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PQLC3Q8N755 202 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2A1Q8NGT9 310 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52P1PQ8NH57 321 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM81AQ8TBF8 368 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PIFOQ8TCI5 191 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NTAN1Q96AB6 310 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC39Q96DD0 335 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 L3HYPDHQ96EM0 354 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PRRC1Q96M27 445 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF5Q99942 180 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXC2Q99958 501 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SIKE1Q9BRV8 207 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CENPKQ9BS16 269 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPL11Q9BXB4 747 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP3A43Q9HB55 503 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM9BQ9NQ34 198 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 VANGL2Q9ULK5 521 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D24Q9ULP9 559 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K19Q56UN5 1328 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SMCO2A6NFE2 343 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 AIM2O14862 343 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FLOT1O75955 427 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNE2O96020 404 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CSTAP01040 98 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NPPAP01160 153 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-DQA1P01909 254 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CD3GP09693 182 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ACSM4P0C7M7 580 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBG1P23258 451 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP2.04□□□□□ -2.086e-10■□□□□ 11.2
RABGGTB-202ENST00000370826 DCKP27707 260 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DAOAP59103 153 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNG7P62955 275 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CDC20Q12834 499 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF726P1Q15940 193 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM150AQ86TG1 271 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MYOCDQ8IZQ8 938 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MNS1Q8NEH6 495 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRB4Q8NHJ6 448 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 ACMSDQ8TDX5 336 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 GPX8Q8TED1 209 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 MITD1Q8WV92 249 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NRGNQ92686 78 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TMIGD2Q96BF3 282 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF157Q96PX1 679 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM17AQ99595 171 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 DOK1Q99704 481 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 BLZF1Q9H2G9 400 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 RGCCQ9H4X1 137 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 BRWD3Q6RI45 1802 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 YEATS2Q9ULM3 1422 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 YKT6O15498 198 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 SOCS1O15524 211 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NMT2O60551 498 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 H6PDO95479 791 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKACBP22694 351 aa2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR3DL2P43630 455 aa2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms