RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363074.1

RNU6-653P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 653, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-653P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-653P-201ENST00000363074 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PDIK1LQ8N165 341 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 C11orf72Q8NBR9 251 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GPR26Q8NDV2 337 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 SLC26A10Q8NG04 563 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MGARPQ8TDB4 240 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GHSRQ92847 366 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 FMO2Q99518 471 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PARD6BQ9BYG5 372 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 TTTY12Q9BZ98 90 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 POLE4Q9NR33 117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 RNF14Q9UBS8 474 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MOSPD1Q9UJG1 213 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ING4Q9UNL4 249 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 DOCK10Q96BY6 2186 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 DENND4AQ7Z401 1863 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 DYSFO75923 2080 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 A0A0J9YXV3 536 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CLRN2A0PK11 232 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 FAM170AA1A519 330 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 KRT87PA6NCN2 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ARPC3O15145 178 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 SOX15O60248 233 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 SEC22BO75396 215 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 SURF6O75683 361 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CLDN9O95484 217 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 DIRAS3O95661 229 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGKV1-39P01597 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGHV1-46P01743 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 THRAP10827 490 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 EPB41P11171 864 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ERGP11308 486 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 NELFEP18615 380 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GZMHP20718 246 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ATP6V1C1P21283 382 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PRKACBP22694 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GRIA1P42261 906 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CCL23P55773 120 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CBX1P83916 185 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ILKQ13418 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PNOCQ13519 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 NCF4Q15080 339 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 QPRTQ15274 297 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF77Q15935 545 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF726P1Q15940 193 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 LYPD6Q86Y78 171 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ERO1BQ86YB8 467 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 NPWQ8N729 165 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 OR52N1Q8NH53 320 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 OR1L1Q8NH94 360 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CXorf40AQ8TE69 158 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CACNG8Q8WXS5 425 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 C10orf35Q96D05 121 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 KCNS1Q96KK3 526 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 C12orf42Q96LP6 360 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 COPS8Q99627 209 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 HSPB9Q9BQS6 159 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM243Q9BU79 118 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 RACGAP1Q9H0H5 632 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 VSIRQ9H7M9 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MTCH1Q9NZJ7 389 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 LRRC42Q9Y546 428 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MYO9BQ13459 2157 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PLXNA3P51805 1871 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 PNPLA6Q8IY17 1366 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 C19orf71A6NCJ1 209 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 GGTLC3B5MD39 225 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CHMP2AO43633 222 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-653P-201ENST00000363074 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms