RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 OR10A4Q9H209 315 aa20.23■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.23■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 GSTT2P0CG29 244 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 TMEM123Q8N131 208 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 OR4D6Q8NGJ1 314 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 GAL3ST1Q99999 423 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GVI7 797 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 GJE1A6NN92 205 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 LDLRAD4O15165 306 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ANOS1P23352 680 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 BDKRB2P30411 391 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 VEGFCP49767 419 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 LINC00303Q3SY05 128 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 Q5BKY6 102 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 C10orf128Q5T292 105 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 PSMF1Q92530 271 aa20.22■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 GABRA1P14867 456 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 AVPR2P30518 371 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 PRSS3P35030 304 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 BCL2A1Q16548 175 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 OR10K2Q6IF99 312 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ZIC4Q8N9L1 334 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 DEPPQ9NTK1 212 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF319Q9P2F9 582 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF222Q9UK12 451 aa20.21■□□□□ 0.83
SNX18-201ENST00000326277 F10P00742 488 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CXCL3P19876 107 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 MSR1P21757 451 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CX3CR1P49238 355 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CYB561P49447 251 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 SELENOPP49908 381 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 LSM6P62312 80 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OR1M1Q8NGA1 313 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ZFAND1Q8TCF1 268 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CNTD2Q9H8S5 307 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 NOX3Q9HBY0 568 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 NCKAP5O14513 1909 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 MEIS3P1A6NDR6 274 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 HPXP02790 462 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ZNF627Q7L945 461 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 SOX7Q9BT81 388 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 NELFAQ9H3P2 528 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.2■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 FABP7O15540 132 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CSF1P09603 554 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 RAC3P60763 192 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 GALK2Q01415 458 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 TNK1Q13470 666 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 CDH24Q86UP0 819 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 GGNQ86UU5 652 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 COMMD2Q86X83 199 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 TAS2R8Q9NYW2 309 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 STMN3Q9NZ72 180 aa20.19■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 DLSTP36957 453 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ZNF529Q6P280 563 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OR4C16Q8NGL9 310 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 NABP1Q96AH0 204 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 GPR84Q9NQS5 396 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 DHHO43323 396 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 SSNA1O43805 119 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 MT-CO3P00414 261 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 RAB3AP20336 220 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 GRB2P62993 217 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.18■□□□□ 0.82
SNX18-201ENST00000326277 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms