RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 NGFP01138 241 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF250P15622 560 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 RGS6P49758 472 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 AADACL4Q5VUY2 407 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GID4Q8IVV7 300 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 OR10S1Q8NGN2 331 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 FAM81AQ8TBF8 368 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TEAD3Q99594 435 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DOK1Q99704 481 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 C8orf4Q9NR00 106 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DUSP13Q9UII6 198 aa14.52□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 E9PQ18 207 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 F5H5K5 113 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 H3BSA7 217 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 J3QW42 95 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GCH1P30793 250 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 PPOXP50336 477 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TAF13Q15543 124 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 LRP11Q86VZ4 500 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ST7LQ8TDW4 575 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SPTSSAQ969W0 71 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 COG8Q96MW5 612 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 COPS4Q9BT78 406 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 CENPMQ9NSP4 180 aa14.51□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 A0A1W2PPW3 197 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF878C9JN71 531 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 M0R233 179 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 CLPTM1O96005 669 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ACSM4P0C7M7 580 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TUBG1P23258 451 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 PEX2P28328 305 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 NUDT6P53370 316 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TPTEP56180 551 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 LPCAT4Q643R3 524 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GALNT4Q8N4A0 578 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 OTOSQ8NHW6 89 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 RDH12Q96NR8 316 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ABHD6Q9BV23 337 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GPR160Q9UJ42 338 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 STARD10Q9Y365 291 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.5□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 M0R135 149 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 NDUFS7O75251 213 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV4-39P01824 125 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 LYNP07948 512 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLC15A1P46059 708 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 GGTLC2Q14390 218 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MOGQ16653 247 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SPATC1Q76KD6 591 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF799Q96GE5 643 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.49□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 H0YHG0 523 aa14.48□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 IGHV3-13P01766 116 aa14.48□□□□□ -0.09
SFTPC-201ENST00000318561 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136 ms