RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.32■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SLC22A13Q9Y226 551 aa18.32■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PCSK6P29122 969 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ISYNA1Q9NPH2 558 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 K7EQS6 105 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 AADACP22760 399 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 KCNJ8Q15842 424 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 M0R296 226 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HBE1P02100 147 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TLE4Q04727 773 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 CDK5R1Q15078 307 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PRRX2Q99811 253 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SMOC1Q9H4F8 434 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 DUSP21Q9H596 190 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF266Q14584 549 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NANPQ8TBE9 248 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 COX14Q96I36 57 aa18.31■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RAB27BO00194 218 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TBX19O60806 448 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 GSK3AP49840 483 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SSPNQ14714 243 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 FAM213BQ8TBF2 198 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TNFSF14O43557 240 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 GMDSO60547 372 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 CASP3P42574 277 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OPCMLQ14982 345 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ACER2Q5QJU3 275 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NOXO1Q8NFA2 376 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TGM6O95932 706 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 MC2RQ01718 297 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 FCN2Q15485 313 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ARHGDIGQ99819 225 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 FOXB1Q99853 325 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM43Q9BTV4 400 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 AIPO00170 330 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 GPX5O75715 221 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ALOX5APP20292 161 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 FAM185AQ8N0U4 392 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR10G3Q8NGC4 313 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HPSE2Q8WWQ2 592 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 EID2BQ96D98 161 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PRR35P0CG20 571 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OTPQ5XKR4 325 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 IMPA2O14732 288 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 FABP7O15540 132 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM200AQ86VY9 491 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 CATSPERDQ86XM0 798 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ST7LQ8TDW4 575 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM200CA6NKL6 621 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ABCD4O14678 606 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR8U8P0C7N1 319 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 RAE1P78406 368 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR52I2Q8NH67 350 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa18.29■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NXPH3O95157 252 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SRP9P49458 86 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TAF9Q16594 264 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HES3Q5TGS1 186 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 OR4C3Q8NH37 302 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 BIN3Q9NQY0 253 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 TMEM235A6NFC5 223 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 POM121CA8CG34 1229 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 HAAOP46952 286 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 ZNF117Q03924 483 aa18.28■□□□□ 0.52
USP25-202ENST00000285681 WDR34Q96EX3 536 aa18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms