RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 RNF165Q6ZSG1 346 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD4AQ8N468 514 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGDIGQ99819 225 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PBOV1Q9GZY1 135 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 AK3Q9UIJ7 227 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RNF150Q9ULK6 438 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FLVCR2Q9UPI3 526 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LRP5O75197 1615 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 E5RGE8 158 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST1O14792 307 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 AGERQ15109 404 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TCTE3Q8IZS6 198 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EXD3Q8N9H8 876 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 GAB2Q9UQC2 676 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC4Q9Y296 219 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NSG2Q9Y328 171 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPH5 198 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-9P01782 118 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 BAP18Q8IXM2 172 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA4Q92187 359 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa19.18■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NRASP01111 189 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RPL12P30050 165 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EMDP50402 254 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LAIR1Q6GTX8 287 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 IL20Q9NYY1 176 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NRAPQ86VF7 1730 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0B4J203 849 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ARR3P36575 388 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF626Q68DY1 528 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SKA3Q8IX90 412 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD53Q8N9V6 530 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SPNS1Q9H2V7 528 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A4GNTQ9UNA3 340 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KNL1Q8NG31 2342 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TBX19O60806 448 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MGMTP16455 207 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NLRC3Q7RTR2 1065 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM2Q8TAZ6 248 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM3Q96MX0 182 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MED29Q9NX70 200 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC3O43542 346 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CD80P33681 288 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RPS27P42677 84 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RPS23P62266 143 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 AGBL4Q5VU57 503 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZRG5 221 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TBX21Q9UL17 535 aa19.17■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PPP5D1E7EU14 171 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ELLP55199 621 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR8G1Q15617 311 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FAAP20Q6NZ36 180 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 GPX8Q8TED1 209 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SHARPINQ9H0F6 387 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 AUNIPQ9H7T9 357 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 B9D1Q9UPM9 204 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPC4 97 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ASPDHA6ND91 283 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 FAM166BA8MTA8 275 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 LYG2Q86SG7 212 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR4Q3Q8NH05 313 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 IP6K3Q96PC2 410 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 APOA2P02652 100 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF573Q86YE8 665 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 H7BYZ3 331 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 DCTDP32321 178 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 GSK3AP49840 483 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE4Q8WWG9 221 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf50Q96LR7 162 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 MED9Q9NWA0 146 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D1BO14796 132 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H8P0DN80 308 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 HRH1P35367 487 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 IL34Q6ZMJ4 242 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TTC9Q92623 222 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 POMT2Q9UKY4 750 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 NME2P1O60361 137 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-201ENST00000284617 TPOP07202 933 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms