RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OR4F4Q96R69 305 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NANSQ9NR45 359 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 U3KQK5 164 aa13.51□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 STARD9Q9P2P6 4700 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FBP2O00757 339 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPT2O15123 496 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRR20EP86478 221 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRR20CP86479 221 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRR20DP86480 221 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRR20BP86481 221 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRR20AP86496 221 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SLC30A8Q8IWU4 369 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OR10A6Q8NH74 314 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF566Q969W8 418 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MPP4Q96JB8 637 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SEPHS2Q99611 448 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PPA2Q9H2U2 334 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa13.5□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 LCE6AA0A183 80 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD1O00168 92 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SURF4O15260 269 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RNF13O43567 381 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OR6A2O95222 327 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 LIPFP07098 398 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 QDPRP09417 244 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FBP1P09467 338 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF32P17041 273 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB10P40306 273 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KIR2DS4P43632 304 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 GDI2P50395 445 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 HIST3H3Q16695 136 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 VMACQ2NL98 169 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FAM201AQ5SY85 155 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC80Q76M96 950 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.49□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 F13BP05160 661 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF1BP20333 461 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KITLGP21583 273 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT2P50583 147 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 UGT2B15P54855 530 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RIPK1Q13546 671 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL22Q53GT1 634 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 RABL3Q5HYI8 236 aa13.48□□□□□ -0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 DCDC5Q6ZRR9 648 aa13.48□□□□□ -0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SPERTQ8NA61 448 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 AKR7LQ8NHP1 331 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PFN4Q8NHR9 129 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ASB10Q8WXI3 467 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF347Q96SE7 839 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 THTPAQ9BU02 230 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 POFUT1Q9H488 388 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.48□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO24O75426 580 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 IGHG1P01857 330 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN19P0C672 248 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CD33P20138 364 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 SNCBQ16143 134 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF181Q2M3W8 571 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB37Q5TC79 503 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NKAIN4Q8IVV8 208 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OR5R1Q8NH85 324 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MCHR2Q969V1 340 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf141Q9NUB4 165 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 CTSZQ9UBR2 303 aa13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 OR7A10O76100 309 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 IGF2P01344 180 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 MT-ND1P03886 318 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 UMPSP11172 480 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 NPY4RP50391 375 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 PSG4Q00888 419 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 TAF11Q15544 211 aa13.46□□□□□ -0.25
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf128Q5T292 105 aa13.46□□□□□ -0.25
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