RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231526.8

TRAPPC13-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC13, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13-201ENST00000231526 RAB19A4D1S5 217 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ARGFXA6NJG6 315 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 MS4A18H0YCH9 400 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SULT2B1O00204 365 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 KCNAB3O43448 404 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DNPH1O43598 174 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CTLA4P16410 223 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDKN1AP38936 164 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TGM4P49221 684 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A1P53007 311 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC13-201ENST00000231526 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR2B6P58173 313 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TAS2R43P59537 309 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GLO1Q04760 184 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SELENBP1Q13228 472 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TGIF1Q15583 401 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC13-201ENST00000231526 MS4A18Q3C1V0 323 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A53Q5H9E4 307 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCAF10Q5QP82 559 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 VASNQ6EMK4 673 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 LINC00299Q6ZSB3 139 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 BEST3Q8N1M1 668 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FADS6Q8N9I5 356 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SCAIQ8N9R8 606 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 C14orf79Q96F83 325 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PELI1Q96FA3 418 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SYT3Q9BQG1 590 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 WDR76Q9H967 626 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CHST11Q9NPF2 352 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ACOXLQ9NUZ1 547 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 IKZF2Q9UKS7 526 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FKBP7Q9Y680 259 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DOCK7Q96N67 2140 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CACNA1GO43497 2377 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 H7C1Q1 480 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PLPP2O43688 288 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TRAPPC6AO75865 159 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC13-201ENST00000231526 SHC1P29353 583 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PER3P56645 1201 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SIRPAP78324 504 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 HSF1Q00613 529 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GPR50Q13585 617 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF846Q147U1 533 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPANXN2Q5MJ10 180 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPINK14Q6IE38 97 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM81Q6P7N7 255 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC16A9Q7RTY1 509 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCXRQ7Z4W1 244 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SYS1Q8N2H4 156 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PRSS33Q8NF86 280 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GHSRQ92847 366 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM186Q96B77 213 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 C5orf30Q96GV9 206 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 Q96M66 194 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZMAT4Q9H898 229 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PROK2Q9HC23 129 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CRIM1Q9NZV1 1036 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 B9D1Q9UPM9 204 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR2M5A3KFT3 312 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 LANCL1O43813 399 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SAP30O75446 220 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 KRT8P05787 483 aa4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF43P17038 809 aa4.79□□□□□ -1.64
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