RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 Q5BKY6 102 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TIGD3Q6B0B8 471 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ANKRD16Q6P6B7 361 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 NTNG2Q96CW9 530 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 UCN2Q96RP3 112 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GAL3ST1Q99999 423 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C20orf85Q9H1P6 137 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 COPZ2Q9P299 210 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.06■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MGAQ8IWI9 3026 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CIB4A0PJX0 185 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GGT3PA6NGU5 568 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ACOT7O00154 380 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CD63P08962 238 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ID4P47928 161 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MMP16P51512 607 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SCAND1P57086 179 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GUCA2AQ02747 115 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MED28Q9H204 178 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.05■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF726A6NNF4 738 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TTLL8A6PVC2 850 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PMS2P2O95744 297 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 H3F3AP84243 136 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 HIST3H3Q16695 136 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 HYAL4Q2M3T9 481 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GLT8D1Q68CQ7 371 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MEIS3P1A6NDR6 274 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FCER2P06734 321 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 HTR2CP28335 458 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GPR85P60893 370 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MAB21L1Q13394 359 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TOMM20Q15388 145 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ST3GAL2Q16842 350 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FGGYQ96C11 551 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR51J1Q9H342 316 aa16.04■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 RER1O15258 196 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 IGHEP01854 428 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ALDOBP05062 364 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SLC2A1P11166 492 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 GZMKP49863 264 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FAPQ12884 760 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 JAGN1Q8N5M9 183 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PHF21AQ96BD5 680 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 MED30Q96HR3 178 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR10A4Q9H209 315 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 DIABLOQ9NR28 239 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A6NL46 340 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 TNFSF11O14788 317 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 C1QBP02746 253 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 CXCL3P19876 107 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 STOMP27105 288 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 PRKXP51817 358 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 AP3S2P59780 193 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR10K2Q6IF99 312 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR56B4Q8NH76 319 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 SOX7Q9BT81 388 aa16.03■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ACACAQ13085 2346 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 A0A0J9YW62 118 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 KLK10O43240 276 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 F10P00742 488 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 VEGFCP49767 419 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 OR2M2Q96R28 347 aa16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP18-201ENST00000215794 NCKAP5O14513 1909 aa16.02■□□□□ 0.15
USP18-201ENST00000215794 IGF2RP11717 2491 aa16.02■□□□□ 0.15
USP18-201ENST00000215794 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms