RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-229	ENST00000638939		A0A1B0GUS0	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SURF4	O15260	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OR5F1	O95221	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	FSTL3	O95633	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	OPN1SW	P03999	348 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	COX5B	P10606	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	KITLG	P21583	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MSR1	P21757	451 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CCNO	P22674	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CDA	P32320	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MTNR1A	P48039	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PCBD1	P61457	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ERVK-25	P63136	954 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DEFA6	Q01524	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	FMOD	Q06828	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CD47	Q08722	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BAMBI	Q13145	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MIDN	Q504T8	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	COG8	Q96MW5	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CGREF1	Q99674	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939		A6NIZ1	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939		M0QX08	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ABHD16A	O95870	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	NGF	P01138	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	DBH	P09172	617 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SBK2	P0C263	348 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	LAP3	P28838	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	AQP2	P41181	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MTPN	P58546	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	TAS2R41	P59536	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BPIFB3	P59826	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RAP1B	P61224	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	RAP1A	P62834	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PAX8	Q06710	450 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	PSG7	Q13046	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	AGK	Q53H12	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PDE4D-229	ENST00000638939	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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