RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590205.2

CACNA1A-210, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, humanhuman

Gene CACNA1A, Length 3,340 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1A-210ENST00000590205 KCNMB1Q16558 191 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ELOA3Q8NG57 546 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM106AQ96A25 262 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 LINC00052Q96N35 136 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 STARD5Q9NSY2 213 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 R4GMQ9 66 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MAOAP21397 527 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CD1CP29017 333 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MMP16P51512 607 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ACTBP60709 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ACTG1P63261 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 GRM7Q14831 915 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 NR0B2Q15466 257 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 HIST3H3Q16695 136 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC26A10Q8NG04 563 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ASB10Q8WXI3 467 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TSSK2Q96PF2 358 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 FAM206AQ9NX38 181 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MPDZO75970 2070 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TLCD2A6NGC4 264 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 LMO7DNF2Z398 122 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 F5H5P2 479 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MS4A18H0YCH9 400 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF208O43345 1280 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 RENP00797 406 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TBPP20226 339 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TACR3P29371 465 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ALDH3B1P43353 468 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF84P51523 738 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 P2RY4P51582 365 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC16A1P53985 500 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF273Q14593 569 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MISPQ8IVT2 679 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF248Q8NDW4 579 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR52N5Q8NH56 324 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR10G6Q8NH81 332 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 DOK4Q8TEW6 326 aa7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A0B4J2A0 478 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A0D9SG52 128 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MEGF11A6BM72 1044 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CEACAM1P13688 526 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ACP1P24666 158 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CLDN12P56749 244 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 IL15RAQ13261 267 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CXorf58Q96LI9 332 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ZNF69Q9UC07 566 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 A0A1B0GTH9 108 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 ICOSLGO75144 302 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR2F2O95006 317 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 GOSR1O95249 250 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 OR4E1P0C645 316 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 UBBP0CG47 229 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 CTSSP25774 331 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 SLC6A9P48067 706 aa7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CACNA1A-210ENST00000590205 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms