RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MTX3Q5HYI7 312 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FAM166AQ6J272 317 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00471Q8N535 108 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K13Q8NH42 304 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ITPKCQ96DU7 683 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TSSK2Q96PF2 358 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SNX18Q96RF0 628 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NMNAT3Q96T66 252 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FUZQ9BT04 418 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MUC13Q9H3R2 512 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 REEP1Q9H902 201 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 U3KQV3 271 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.276e-9■■■□□ 15.3
PTPRM-214ENST00000583153 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GNGT2O14610 69 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT8O14734 319 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ARPC3O15145 178 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RER1O15258 196 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GPANK1O95872 356 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TXNDC12O95881 172 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NGFP01138 241 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GASTP01350 101 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-13P01766 116 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 COX5BP10606 129 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF12P17014 697 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GSTM3P21266 225 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ACHEP22303 614 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MPV17P39210 176 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PSMD7P51665 324 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM33P57088 247 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FXYD6P3P58550 94 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A2Q01362 244 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CBX3Q13185 183 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RIN1Q13671 783 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MEP1BQ16820 701 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LCN8Q6JVE9 175 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GJC3Q8NFK1 279 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM15Q9C019 465 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TREM2Q9NZC2 230 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 B9D1Q9UPM9 204 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DCTN6O00399 190 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ST8SIA5O15466 376 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IDH3BO43837 385 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LILRA1O75019 489 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NCR1O76036 304 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TACSTD2P09758 323 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF823P16415 610 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HNF1AP20823 631 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LIPAP38571 399 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GSSP48637 474 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HMGA2P52926 109 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MVKQ03426 396 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MICAQ29983 383 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HFEQ30201 348 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SLC36A3Q495N2 470 aa7.1□□□□□ -1.27
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