RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	COQ2	Q96H96	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	STAC	Q99469	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	WDR54	Q9H977	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		H3BMQ9	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		H3BN98	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		H3BNH8	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNK1	O00180	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDIPT	O14735	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB29	O14966	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT2B17	O75795	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CGA	P01215	116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PGAM2	P15259	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	XCR1	P46094	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPOX	P50336	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TESC	Q96BS2	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYRM4	Q9HD34	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	WDR97	A6NE52	1622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A087WWV3	80 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GU03	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	GJE1	A6NN92	205 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		B4DXG7	233 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909		G3V4G9	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	DFFA	O00273	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAPBP	O15533	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	SGCE	O43556	437 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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