RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		Q9UF83	564 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TFR2	Q9UP52	801 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC42	Q9Y546	428 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRG6	482 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TVP23A	A6NH52	213 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB7	A8K855	629 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MPTX1	A8MV57	137 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BQV1	296 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EN84	100 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	DFFA	O00273	331 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD51C	O43502	376 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HPGDS	O60760	199 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP6	O75344	327 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GPX5	O75715	221 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMG1	O95456	288 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HPRT1	P00492	218 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GCG	P01275	180 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA5	P01569	189 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CD8A	P01732	235 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AL1	P0C617	328 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RD3L	P0DJH9	198 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMD1	P0DJR0	217 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	COX5B	P10606	129 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF250	P15622	560 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A5	P22732	501 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD11B1	P28845	292 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	BTD	P43251	543 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	KIR3DL2	P43630	455 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HCCS	P53701	268 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE2K	P61086	200 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVS71-1	P61550	626 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HMGCS1	Q01581	520 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMG2	Q02383	582 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF92	Q03936	586 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ECH1	Q13011	328 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ASAH1	Q13510	395 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR7A5	Q15622	319 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	LTB4R	Q15722	352 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM189A2	Q15884	450 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	POU2AF1	Q16633	256 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	NRF1	Q16656	503 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MICA	Q29983	383 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTBL2	Q562R1	376 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	FTMT	Q8N4E7	242 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PIFO	Q8TCI5	191 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	IFT81	Q8WYA0	676 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	YIPF6	Q96EC8	236 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	SGTB	Q96EQ0	304 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A14	Q96JA4	679 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	C18orf12	Q96KH6	178 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5B12	Q96R08	314 aa		2.21	□□□□□ -2.06
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H4G	Q99525	98 aa		2.21	□□□□□ -2.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms