RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DCTP40126 519 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A9P48067 706 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR2F1Q13607 317 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ABRAXAS2Q15018 415 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF10Q5QP82 559 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZNB5 142 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 MMP26Q9NRE1 261 aa5.76□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.75□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF883P0CG24 379 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FPR1P21462 350 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CD34P28906 385 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 KDELR2P33947 212 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ASCL1P50553 236 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
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