RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FDX2Q6P4F2 183 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 WDR31Q8NA23 367 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 S100PBPQ96BU1 408 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MAP6Q96JE9 813 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RGCCQ9H4X1 137 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CENPMQ9NSP4 180 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HCFC1P51610 2035 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 WIPF3A6NGB9 483 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 VSTM5A8MXK1 200 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 J3QKU1 62 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 J3QLW9 94 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RER1O15258 196 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 GPRIN2O60269 458 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ICMTO60725 284 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZG16O60844 167 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SEC14L2O76054 403 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 AGFG2O95081 481 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 APOL3O95236 402 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HTR1AP08908 422 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF12P17014 697 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF19P17023 458 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PTAFRP25105 342 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PCSK6P29122 969 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 HTR5AP47898 357 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PIGFQ07326 219 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MED22Q15528 200 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TRAM1Q15629 374 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CORO6Q6QEF8 472 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.12□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 MDP1Q86V88 176 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.12□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 ZNF649Q9BS31 505 aa8.12□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.12□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.11□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 M0R135 149 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CASKO14936 926 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 IGLV1-44P01699 117 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 CRYAAP02489 173 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 PCMT1P22061 227 aa8.11□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 RAD52P43351 418 aa8.11□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 LIPNQ5VXI9 398 aa8.11□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
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CS-220ENST00000550700 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-220ENST00000550700 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.11□□□□□ -1.11
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