RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 ACTG2P63267 376 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 TSC22D1Q15714 1073 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.73□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.73□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 TEX46H3BTG2 121 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 ARPC5O15511 151 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 IGF2P01344 180 aa14.72□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 MPGP29372 298 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 CYB561P49447 251 aa14.72□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 CDK5R1Q15078 307 aa14.72□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BRF1-208ENST00000546997 MGMTP16455 207 aa14.71□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.71□□□□□ -0.05
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BRF1-208ENST00000546997 PGCP20142 388 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 DPP4P27487 766 aa14.71□□□□□ -0.06
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BRF1-208ENST00000546997 LINC00303Q3SY05 128 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SPINK14Q6IE38 97 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PGAP1Q75T13 922 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 LIPHQ8WWY8 451 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-208ENST00000546997 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.71□□□□□ -0.06
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BRF1-208ENST00000546997 ADAM19Q9H013 955 aa14.71□□□□□ -0.06
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