RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 TGM6O95932 706 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 HSPB2Q16082 182 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 C3AR1Q16581 482 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 TMEM99Q8N816 258 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 KIR2DS1Q14954 304 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 COPS3Q9UNS2 423 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR10J4P0C629 311 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 TEX37Q96LM6 180 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 PLK3Q9H4B4 646 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR2A25A4D2G3 310 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 RCE1Q9Y256 329 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 ASB5Q8WWX0 329 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 OPRM1P35372 400 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-204ENST00000538708 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 MICBQ29980 383 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 OR10AD1Q8NGE0 317 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-204ENST00000538708 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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