RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	SYNGR3	O43761	229 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	PATE4	P0C8F1	98 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	BMP4	P12644	408 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	MYL12A	P19105	171 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DCK	P27707	260 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	HSD11B1	P28845	292 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ACTA2	P62736	377 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ACTG2	P63267	376 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	MOG	Q16653	247 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CDC20B	Q86Y33	519 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.26	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ABCA4	P78363	2273 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SELENOF	O60613	162 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SULT1C4	O75897	302 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CLIC3	O95833	236 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	GPANK1	O95872	356 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SCG5	P05408	212 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	KRT8	P05787	483 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC159	P0C7I6	412 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DCTD	P32321	178 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	TLE4	Q04727	773 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	SNX33	Q8WV41	574 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF75A	Q96N20	296 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	DAPL1	A0PJW8	107 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	FAM221A	A4D161	298 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ICMT	O60725	284 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	FAM20B	O75063	409 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CTAG2	O75638	210 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ABHD16A	O95870	558 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	GNAO1	P09471	354 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF35	P13682	527 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CCNO	P22674	350 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ROM1	Q03395	351 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	ST7L	Q8TDW4	575 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	HTRA1	Q92743	480 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BBS1-224	ENST00000534730	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29

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