RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524955.1

CHMP4A-202, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 268 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-202ENST00000524955 OR6C6A6NF89 314 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 C3orf80F5H4A9 247 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 M0R135 149 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC16A6O15403 523 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 PRODHO43272 600 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 XPNPEP2O43895 674 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 LILRA1O75019 489 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TMCC2O75069 709 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 WBP4O75554 376 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 H2BFMP0C1H6 154 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SBK2P0C263 348 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ACSM4P0C7M7 580 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DANCRP0C864 163 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 NAT2P11245 290 aa3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 HSD11B1P28845 292 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 HTR1FP30939 366 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ATP6V1E1P36543 226 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SERPINF1P36955 418 aa3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 PSMB10P40306 273 aa3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 CXCR4P61073 352 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 MVKQ03426 396 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF91Q05481 1191 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 ODF4Q2M2E3 257 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 NRN1LQ496H8 165 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TP53I3Q53FA7 332 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SPRNQ5BIV9 151 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 GLYATL3Q5SZD4 288 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF691Q5VV52 312 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 OR2T2Q6IF00 324 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 FAM57BQ71RH2 274 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 KRT77Q7Z794 578 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SYT9Q86SS6 491 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 OTOSQ8NHW6 89 aa3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 CMBLQ96DG6 245 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF799Q96GE5 643 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SOX7Q9BT81 388 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ADI1Q9BV57 179 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 C1orf198Q9H425 327 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 PLK3Q9H4B4 646 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 MARCH7Q9H992 704 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 MSL2Q9HCI7 577 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 CLN6Q9NWW5 311 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TREM2Q9NZC2 230 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.95□□□□□ -1.78
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CHMP4A-202ENST00000524955 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 LRP12Q9Y561 859 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.95□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 DAPL1A0PJW8 107 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 A6NIN4 97 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF878C9JN71 531 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 H0YL77 283 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 SPRY3O43610 288 aa3.94□□□□□ -1.78
CHMP4A-202ENST00000524955 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
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