RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 OR2T2Q6IF00 324 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.22□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.22□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 DGCR6Q14129 220 aa14.21□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 SEC23BQ15437 767 aa14.21□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 ESCO2Q56NI9 601 aa14.21□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 MRI1Q9BV20 369 aa14.21□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.21□□□□□ -0.13
HERC3-211ENST00000513325 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.21□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.21□□□□□ -0.13
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HERC3-211ENST00000513325 J3QW42 95 aa14.2□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 DIRAS1O95057 198 aa14.2□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF205O95201 554 aa14.2□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 H0YL77 283 aa14.19□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 NDUFAB1O14561 156 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 TXNDC12O95881 172 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HKR1P10072 659 aa14.19□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 RPS6KA3P51812 740 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST1H3AP68431 136 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PAX8Q06710 450 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 FOXL1Q12952 345 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 GLYATQ6IB77 296 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 CORO6Q6QEF8 472 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 GJC3Q8NFK1 279 aa14.19□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 C7orf34Q96L11 122 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM165Q9HC07 324 aa14.19□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.19□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 IFNL4K9M1U5 179 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 MLNRO43193 412 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 WIPF1O43516 503 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R3DO95685 299 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
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HERC3-211ENST00000513325 PSME3P61289 254 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 BAMBIQ13145 260 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
HERC3-211ENST00000513325 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
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