RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 GABARAPL2P60520 117 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ACTC1P68032 377 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ACTA1P68133 377 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 ST3GAL4Q11206 333 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 SLC36A2Q495M3 483 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 LRRC18Q8N456 261 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 EMC7Q9NPA0 242 aa9.85□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.85□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.84□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 C1orf198Q9H425 327 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP21Q9H596 190 aa9.84□□□□□ -0.83
UBE2B-208ENST00000511807 RNF121Q9H920 327 aa9.84□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.84□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 POU2F3Q9UKI9 436 aa9.84□□□□□ -0.83
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UBE2B-208ENST00000511807 APOL3O95236 402 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 WNT11O96014 354 aa9.83□□□□□ -0.84
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UBE2B-208ENST00000511807 SCG5P05408 212 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CDK1P06493 297 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 LYNP07948 512 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 ALOX5APP20292 161 aa9.83□□□□□ -0.84
UBE2B-208ENST00000511807 CAPZA2P47755 286 aa9.83□□□□□ -0.84
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