RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP2-215ENST00000510074 CROCCP2Q86T23 111 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP2-215ENST00000510074 MREGQ8N565 214 aa13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM100Q9NV29 134 aa13.18□□□□□ -0.3
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SH3BP2-215ENST00000510074 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP2-215ENST00000510074 XKRYO14609 159 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-215ENST00000510074 DBHP09172 617 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-215ENST00000510074 IFNA8P32881 189 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-215ENST00000510074 RPL4P36578 427 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC18A1P54219 525 aa13.13□□□□□ -0.31
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SH3BP2-215ENST00000510074 EGR3Q06889 387 aa13.13□□□□□ -0.31
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