RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 RCN1Q15293 331 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 C10orf128Q5T292 105 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 LEG1Q6P5S2 330 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 VHLLQ6RSH7 139 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 PARP8Q8N3A8 854 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 STMN2Q93045 179 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 NABP1Q96AH0 204 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DUX5Q96PT3 197 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 NMNAT3Q96T66 252 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SLC29A1Q99808 456 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ALG12Q9BV10 488 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SYT4Q9H2B2 425 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 FN3KQ9H479 309 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 NOX3Q9HBY0 568 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 USE1Q9NZ43 259 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.36□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 A0A096LPE4 126 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PPZ6 126 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR6C68A6NDL8 312 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 H3BN98 237 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 M0QZ24 198 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DLGAP1O14490 977 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 IDH3BO43837 385 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 BAG2O95816 211 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 GPANK1O95872 356 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SCG5P05408 212 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR4A8P0C604 315 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 LYNX1P0DP58 116 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DAOP14920 347 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 B4GALT1P15291 398 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CTLA4P16410 223 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CDAP32320 146 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 GRK5P34947 590 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 GIPRP48546 466 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CRISP1P54107 249 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TUBA1BP68363 451 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TUBA4AP68366 448 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DAG1Q14118 895 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CRMP1Q14194 572 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 GINS1Q14691 196 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ADIPOQQ15848 244 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 THEM4Q5T1C6 240 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OTPQ5XKR4 325 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 LPCAT4Q643R3 524 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TUBA1AQ71U36 451 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 DOK3Q7L591 496 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 REC114Q7Z4M0 266 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 ADCK1Q86TW2 530 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SKA3Q8IX90 412 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR6V1Q8N148 313 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CBR4Q8N4T8 237 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR2T33Q8NG76 320 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 OR4K13Q8NH42 304 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.35□□□□□ -1.39
C9orf135-204ENST00000495399 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms