RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM106BQ9NUM4 274 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A6P31641 620 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 GJC3Q8NFK1 279 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR4K13Q8NH42 304 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ITLN1Q8WWA0 313 aa23.45■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 A0A0G2JMP0 313 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0X1KG70 313 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR6C68A6NDL8 312 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR10H3O60404 316 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 CFAP77Q6ZQR2 320 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR4M2Q8NGB6 313 aa23.44■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 J3QLI3 93 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 OR2V2Q96R30 315 aa23.43■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 ADRA2CP18825 462 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF1AP19438 455 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1B2P21281 511 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 GGT2P36268 569 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 LCN2P80188 198 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 DCAF12L2Q5VW00 463 aa23.42■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 POLR1DQ9Y2S0 133 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 EPHA1P21709 976 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 TNFSF4P23510 183 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZMYND11Q15326 602 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR2T2Q6IF00 324 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 LINC00346Q8IVM7 164 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 SDR9C7Q8NEX9 313 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 GCM1Q9NP62 436 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa23.41■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4EA0A075B759 164 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 F5H0A9 414 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4DF5H284 164 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 MLNRO43193 412 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 IDH3BO43837 385 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 RENP00797 406 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4FP0DN26 164 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 CENPAP49450 140 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXB3-211ENST00000490677 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM155Q4W5P6 130 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR8G5Q8NG78 346 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 OR4C15Q8NGM1 316 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 ZFAND2BQ8WV99 257 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB3-211ENST00000490677 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa23.4■■□□□ 1.34
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