RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489453.1

CHKB-211, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 722 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-211ENST00000489453 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.7□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PRSS37A4D1T9 235 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OR6C6A6NF89 314 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 SRRM5B3KS81 715 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 J3QW42 95 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 M0QZ24 198 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MRASO14807 208 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 IFNW1P05000 195 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 CD14P08571 375 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KDELR2P33947 212 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 CENPAP49450 140 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ERFP50548 548 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FGF12P61328 243 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MAPRE2Q15555 327 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 LRRC75AQ8NAA5 344 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 BHLHE23Q8NDY6 225 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OR2T12Q8NG77 320 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 C10orf82Q8WW14 230 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 SLC7A6Q92536 515 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 UBE2FQ969M7 185 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 Q96M85 177 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TECTBQ96PL2 329 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MARCH7Q9H992 704 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TMEM165Q9HC07 324 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 NOX4Q9NPH5 578 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TMEM100Q9NV29 134 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MRGBPQ9NV56 204 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 GID8Q9NWU2 228 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.69□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 A0A0G2JK05 382 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 F5H5P2 479 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 H0YL77 283 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PHYHO14832 338 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TIMM23O14925 209 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 SLC16A7O60669 478 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZNF682O95780 498 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 NPPAP01160 153 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 CTLA4P16410 223 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 SELEP16581 610 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FPR3P25089 353 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 BPIFB3P59826 476 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 SELENOWP63302 87 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PAX2Q02962 417 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 KCNJ8Q15842 424 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZNF404Q494X3 552 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZBED5Q49AG3 693 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MESTQ5EB52 335 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FBXW12Q6X9E4 464 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZNF583Q96ND8 569 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 J3KTA2 159 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 GSTA4O15217 222 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 RER1O15258 196 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 DBHP09172 617 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 RAD23AP54725 363 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 MALLQ13021 153 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 PDCD1Q15116 288 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 COQ5Q5HYK3 327 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 FAM201AQ5SY85 155 aa8.67□□□□□ -1.02
CHKB-211ENST00000489453 OTPQ5XKR4 325 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms